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16s/ITS/18s扩增子测序
16S rRNA基因普遍存在于细菌和古细菌中,具有多个拷贝数,全长1500 bp左右,其结构由9个可变区(variable region)和10个保守区(conserved region)交替组成。基于16S rRNA扩增子测序(如V3-V4)的微生物群落多样性分析方法已被广泛应用,通过分析微生物群落中物种分布、群落特征和功能,寻找不同样本或组间的差异菌群,挖掘样本表型与微生物群落特征的关联,进而阐明微生物与环境间的相互作用关系。
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